O SC Braga chegou a acordo com o Farense para a transferência em definitivo de Stojiljković, depois de ter cumprido a última temporada ao serviço do Boavista, por empréstimo do clube bracarense.
O avançado de 28 anos somou 85 jogos e 25 golos ao serviço do SC Braga, terminando, assim, a sua ligação contratual com o SC Braga após cinco épocas.